Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Slco1c1Q9ERB5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Slco1c1Q9ERB5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms