Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERA6

Tfip11, Tuftelin-interacting protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 838 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tfip11Q9ERA6 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tfip11Q9ERA6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Tfip11Q9ERA6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tfip11Q9ERA6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms