Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER63

Tnfrsf23, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 23, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf23Q9ER63 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Tnfrsf23Q9ER63 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Tnfrsf23Q9ER63 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms