Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER56

Capn12, Calpain-12, mousemouse

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn12Q9ER56 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Capn12Q9ER56 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Capn12Q9ER56 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms