Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ45

Vmn1r46, Vomeronasal type-1 receptor 46, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r46Q9EQ45 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vmn1r46Q9EQ45 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Vmn1r46Q9EQ45 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms