Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Ropn1lQ9EQ00 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ropn1lQ9EQ00 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms