Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Clstn1Q9EPL2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Clstn1Q9EPL2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Clstn1Q9EPL2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 520.8 ms