Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPJ9

Arfgap1, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgap1Q9EPJ9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Arfgap1Q9EPJ9 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Arfgap1Q9EPJ9 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms