Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Rnft1Q9DCN7 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Rnft1Q9DCN7 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms