Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Tspan4Q9DCK3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Tspan4Q9DCK3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms