Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
GabarapQ9DCD6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
GabarapQ9DCD6 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms