Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Syde1Q9DBZ9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Syde1Q9DBZ9 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms