Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBY5

Cbx6, Chromobox protein homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx6Q9DBY5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Cbx6Q9DBY5 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Cbx6Q9DBY5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms