Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gm14667-201ENSMUST00000119448 1350 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gm32877-201ENSMUST00000197419 709 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gm36377-201ENSMUST00000220833 757 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Atp6v1c2-207ENSMUST00000156727 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gm16107-201ENSMUST00000162523 862 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Prl6a1-201ENSMUST00000091679 1093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Prl6a1-202ENSMUST00000091680 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Nr6a1os-201ENSMUST00000129089 645 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 4933400A11Rik-201ENSMUST00000068874 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 4933400A11Rik-202ENSMUST00000068894 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gm43692-201ENSMUST00000198236 1062 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Olfr1437-201ENSMUST00000052558 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Riok3Q9DBU3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Gm11077-201ENSMUST00000111844 84 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Gm35638-201ENSMUST00000220724 652 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Gm10702-201ENSMUST00000098929 1268 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Riok3Q9DBU3 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.9 ms