Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

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Length 169 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Pop5Q9DB28 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Pop5Q9DB28 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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