Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Q9DAE8 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DAE8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Q9DAE8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DAE8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Q9DAE8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DAE8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DAE8 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DAE8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAE8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms