Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Tmem239Q9DA47 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Tmem239Q9DA47 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms