Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8N6

Lin37, Protein lin-37 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lin37Q9D8N6 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Lin37Q9D8N6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Lin37Q9D8N6 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms