Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7F7

Chmp4c, Charged multivesicular body protein 4c, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4cQ9D7F7 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Chmp4cQ9D7F7 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Chmp4cQ9D7F7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms