Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6N1

Ca13, Carbonic anhydrase 13, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ca13Q9D6N1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ca13Q9D6N1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ca13Q9D6N1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms