Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ccdc94Q9D6J3 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Ccdc94Q9D6J3 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ccdc94Q9D6J3 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms