Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5E3

4930449I24Rik, RIKEN cDNA 4930449I24 gene, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930449I24RikQ9D5E3 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
4930449I24RikQ9D5E3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
4930449I24RikQ9D5E3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20■□□□□ 0.79
4930449I24RikQ9D5E3 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms