Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J9

4931423N10Rik, MCG52616, mousemouse

Predictions only

Length 382 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931423N10RikQ9D4J9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931423N10RikQ9D4J9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
4931423N10RikQ9D4J9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
4931423N10RikQ9D4J9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC20.89■□□□□ 0.94
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
4931423N10RikQ9D4J9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
4931423N10RikQ9D4J9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
4931423N10RikQ9D4J9 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
4931423N10RikQ9D4J9 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
4931423N10RikQ9D4J9 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms