Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4J1

Efhd1, EF-hand domain-containing protein D1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhd1Q9D4J1 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Efhd1Q9D4J1 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Efhd1Q9D4J1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms