Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C5

Eaf1, ELL-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eaf1Q9D4C5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Eaf1Q9D4C5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Eaf1Q9D4C5 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms