Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
4933425L06RikQ9D3Z8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
4933425L06RikQ9D3Z8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms