Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.75□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC6.74□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Eaf1-201ENSMUST00000022446 4918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Iws1-201ENSMUST00000025243 9613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Fn1-216ENSMUST00000189821 7410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Lsm11-202ENSMUST00000129820 6453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ikzf1-204ENSMUST00000076700 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Rgs6-208ENSMUST00000186458 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.73□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Eml6-201ENSMUST00000058902 8083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.72□□□□□ -1.33
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.72□□□□□ -1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms