Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3U0

Pus10, Putative tRNA pseudouridine synthase Pus10, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pus10Q9D3U0 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Pus10Q9D3U0 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pus10Q9D3U0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pus10Q9D3U0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms