Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3T1

4933436I01Rik, RIKEN cDNA 4933436I01, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933436I01RikQ9D3T1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4933436I01RikQ9D3T1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4933436I01RikQ9D3T1 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms