Protein–RNA interactions for Protein: Q9D394

Rufy3, Protein RUFY3, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy3Q9D394 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rufy3Q9D394 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rufy3Q9D394 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms