Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2Q3

Uncharacterized protein C10orf88 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D2Q3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Q9D2Q3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D2Q3 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D2Q3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
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