Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
4930583I09RikQ9D2E3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
4930583I09RikQ9D2E3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms