Protein–RNA interactions for Protein: Q9D275

Batf3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 118 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Batf3Q9D275 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Batf3Q9D275 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Batf3Q9D275 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms