Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1E5

Lmbr1l, Protein LMBR1L, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmbr1lQ9D1E5 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmbr1lQ9D1E5 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Lmbr1lQ9D1E5 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Lmbr1lQ9D1E5 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms