Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1B9

Mrpl28, 39S ribosomal protein L28, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 257 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl28Q9D1B9 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Mrpl28Q9D1B9 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Mrpl28Q9D1B9 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms