Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Syf2Q9D198 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Syf2Q9D198 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Syf2Q9D198 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms