Protein–RNA interactions for Protein: Q9D176

Susd3, Sushi domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Susd3Q9D176 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Susd3Q9D176 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Susd3Q9D176 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Susd3Q9D176 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms