Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Lsm12Q9D0R8 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Lsm12Q9D0R8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms