Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZP0

Ufsp1, Ufm1-specific protease 1, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufsp1Q9CZP0 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm43981-201ENSMUST00000203285 1467 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 AC130831.1-201ENSMUST00000224546 1474 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm12718-202ENSMUST00000156144 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm37845-201ENSMUST00000194977 355 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Prl7a1-203ENSMUST00000224852 1283 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Defb12-201ENSMUST00000062113 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Prl7a1-201ENSMUST00000006659 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm37576-201ENSMUST00000194228 372 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 A930036I15Rik-201ENSMUST00000196018 1045 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Sult3a1-202ENSMUST00000218204 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Sult3a1-201ENSMUST00000092597 1047 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 V1rg10-201ENSMUST00000183378 937 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Smr2-202ENSMUST00000196070 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 AC154683.1-201ENSMUST00000228409 1284 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 mt-Nd3-201ENSMUST00000082411 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Ufsp1Q9CZP0 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Gm12656-201ENSMUST00000118149 577 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Gm5277-201ENSMUST00000164923 556 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 CT025538.2-201ENSMUST00000226083 772 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Mndal-202ENSMUST00000186442 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Ufsp1Q9CZP0 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms