Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis18aQ9CZJ6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis18aQ9CZJ6 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis18aQ9CZJ6 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis18aQ9CZJ6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis18aQ9CZJ6 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis18aQ9CZJ6 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Mis18aQ9CZJ6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Mis18aQ9CZJ6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Mis18aQ9CZJ6 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms