Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXY1

Tmem175, Endosomal/lysosomal potassium channel TMEM175, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem175Q9CXY1 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem175Q9CXY1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem175Q9CXY1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem175Q9CXY1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem175Q9CXY1 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Tmem175Q9CXY1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem175Q9CXY1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem175Q9CXY1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Tmem175Q9CXY1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem175Q9CXY1 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem175Q9CXY1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms