Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL3

Uncharacterized protein C7orf50 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CXL3 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Q9CXL3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Q9CXL3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Q9CXL3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Q9CXL3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CXL3 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CXL3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CXL3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CXL3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Q9CXL3 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms