Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXH7

Sgo1, Shugoshin 1, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgo1Q9CXH7 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
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Sgo1Q9CXH7 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sgo1Q9CXH7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sgo1Q9CXH7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sgo1Q9CXH7 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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Sgo1Q9CXH7 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sgo1Q9CXH7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Sgo1Q9CXH7 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sgo1Q9CXH7 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sgo1Q9CXH7 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
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Sgo1Q9CXH7 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Sgo1Q9CXH7 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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Sgo1Q9CXH7 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sgo1Q9CXH7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
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