Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXC3

Mgme1, Mitochondrial genome maintenance exonuclease 1, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mgme1Q9CXC3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Mgme1Q9CXC3 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Mgme1Q9CXC3 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms