Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Psmd8Q9CX56 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Psmd8Q9CX56 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms