Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT6

Ddx28, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ddx28Q9CWT6 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Ddx28Q9CWT6 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms