Protein–RNA interactions for Protein: Q9CVD2

Atxn3, Ataxin-3, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn3Q9CVD2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Atxn3Q9CVD2 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Atxn3Q9CVD2 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atxn3Q9CVD2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms