Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSN1

Snw1, SNW domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snw1Q9CSN1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Snw1Q9CSN1 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Snw1Q9CSN1 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms