Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Q9CRC3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Q9CRC3 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms