Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR92

Ccdc96, Coiled-coil domain-containing protein 96, mousemouse

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc96Q9CR92 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc96Q9CR92 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc96Q9CR92 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ccdc96Q9CR92 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms